Eine der Stärken des Annastifts ist die interdisziplinäre Zusammenarbeit mit anderen medizinischen Einrichtungen. Das Department für Kinder- und Neuroorthopädie kooperiert mit verschiedenen Sozialpädiatrischen Zentren (SPZs) in Norddeutschland, wie dem SPZ Hannover, ZEUS Wolfsburg und dem Kinderzentrum Bremen. Gemeinsame Sprechstunden mit Neuropädiatern und Physiotherapeuten sorgen für eine ganzheitliche Betreuung der Patienten.